monophylétique, paraphylétique et polyphylétique
ayant couvert les bases de la taxonomie et de la lecture des arbres phylogénétiques, il est loin le temps que j’aurais dû traiter du concept de monophylie et c’est ‘ugly sisters’, paraphylétique et polyphylie. Bien que les termes ne soient pas familiers, les concepts qui les sous-tendent sont simples et pratiques et je soupçonne qu’au moins quelques lecteurs les connaîtront même s’ils ne pouvaient pas réellement dire ce qu’ils étaient (pour ainsi dire)., Les trois termes décrivent tous différentes façons de regrouper les taxons et sont plus facilement démontrés sur un arbre phylogénétique (bien qu’ils n’en aient pas besoin en tant que tels).
Les groupes et lignées monophylétiques sont la base fondamentale de la taxonomie et de l’évolution dans son ensemble. Tout au sein d’un groupe monophylétique est le descendant d’un seul ancêtre commun et sont donc les clades dont nous parlons généralement en biologie et en paléontologie. Ici, le clade comprenant les taxons A, B, C et D est monophylétique., Tout ce qui descend de la lignée ancestrale ou de l’organisme qui existait au point marqué par la flèche rouge appartient à ce clade et c’est donc un groupe monphylétique. Si nous découvrions plus tard de nouveaux parents qui s’insèrent n’importe où dans l’arbre au-dessus de ce point, ils feraient également partie de ce clade monophylétique. Évidemment, le clade A-D n’est pas le seul monphylétique de cet arbre, on pourrait nommer un clade de juste un & B, Ou A-F et ce serait toujours monophylétique.,
Les groupes paraphylétiques n’incluent pas tous les descendants d’un seul ancêtre commun. Cela signifie que bien que le groupe ait un ancêtre commun, nous ignorons artificiellement un sous-ensemble de ses descendants. Ici, les flèches vertes indiquent d’abord le groupe monophylétique que nous considérons (A-F), puis le deuxième groupe monophylétique (a & B) que nous ne considérons pas, nous laissant ainsi avec le clade paraphylétique de C-F. comme précédemment, il existe d’autres façons de créer un groupe paraphylétique sur cet arbre et j’en illustre simplement un.,
cela peut sembler étrange, mais les groupes paraphylétiques sont toujours utilisés car ils ont une valeur pratique pour décrire certains groupes. Les plus évidents pour les lecteurs ici sont les dinosaures. Les oiseaux sont des dinosaures, c’est-à-dire qu’ils sont les descendants directs d’un ancêtre qui a engendré les dinosaures, mais les paléontologues se réfèrent généralement aux dinosaures tout en ne se référant pas explicitement aux oiseaux. Ainsi, on devrait formellement les appeler dinosaures non-aviaires (essentiellement tous les dinosaures sauf les oiseaux) et cela se produit assez régulièrement, pensé pas toujours, et certainement pas dans la presse., Deux autres méritent d’être mentionnés, l’un en ce qui concerne ce blog régulièrement et un autre comme un exemple frappant d’un groupe paraphylétique. Tout d’abord les ptérosaures rhamphorhynchoïdes (ou plus correctement « rhamphorhynchoïdes » comme les citations le dénotent comme paraphylétique) qui viennent souvent ici dans Mes fréquents messages sur les ptérosaures. Comme pour les dinosaures non-aviaires, le terme persiste comme un commodité car il est fondamentalement plus facile à écrire que « ptérosaures non-ptérodactyloïdes” (ou un exemple plus extrême, on peut appeler Plaetosaurus un « prosauropode”, ou un » sauropodan Non-sauropodan sauropodomorph »)., Enfin, il y a le groupe le plus évident de tous – les poissons, ou plutôt « poissons ». Oui Les Poissons sont évidemment paraphylétiques puisque tous les vertébrés ont un seul ancêtre commun, mais les tétrapodes en descendent mais personne n’appelle les mammifères ou les oiseaux poissons n’est-ce pas?
Les groupes Polyphylétiques sont ceux qui ont des origines multiples et ne partagent donc pas un ancêtre commun ou en fait beaucoup en commun à part quelque trait les maintient ensemble. Ici, les différents taxons surlignés en bleu ont été rassemblés en un groupe polyphylétique, et encore une fois, on pourrait le faire de nombreuses façons, même sur ce petit arbre., Les groupes polyphylétiques sont rarement mentionnés (pour des raisons évidentes), mais ils apparaissent occasionnellement lorsqu’une révision a conduit à ce qu’un groupe auparavant monopylétique ou même paraphylétique soit déclaré polyphylétique à la suite d’un réarrangement systématique (par exemple, « nous avons constaté que les taxons X et Y ne sont pas membres du clade Q et appartiennent en fait à deux clades différents, ainsi le clade Q dans sa définition actuelle est polophylétique et une nouvelle définition est nécessaire qui exclut X et Y »)., Un exemple évident de l’histoire est les pachydermes (éléphants, rhinocéros et hippopotames) qui, bien sûr, appartiennent tous à différentes familles de mammifères et ont été assemblés sur la base de quelques caractères mineurs de leur peau.
J’espère que cela rend tout clair et explique la fixation avec le terme monophylétique qui surgit souvent sur les forums de dinosaures (et même ceux évolutifs en général). Les groupes monophylétiques sont les seuls taxonomiquement et systématiquement viables-c’est-à-dire qu’ils représentent l’histoire évolutive., Comme indiqué paraphylétiques sont utiles pour la simplicité rhétorique, à condition que tout le monde est clair qu’ils sont paraphylétiques et dans quel sens ils sont appliqués. Les polyphylétiques ne sont jamais utilisés, sauf lorsqu’il s’agit de changements de statut taxonomique, ou bien sûr dans les termes les plus généraux (les « bipèdes » sont polyphylétiques).
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juste un petit ajout très tardif-j’ai remarqué que cette page reçoit beaucoup de trafic qui n’est jamais apporté par les moteurs de recherche ou lié à partir d’autres sites et semble exploser certains jours., Je suis sûr que c’est parce que cela est utilisé comme ressource pédagogique et que les conférenciers indiquent l’url aux étudiants. Si oui, génial! mais j’aimerais savoir si c’est le cas. Si vous avez été envoyé ici par votre professeur, veuillez mettre un commentaire ci-dessous et laissez-moi savoir dans quel collège / université vous êtes. Grâce.