co je sekvenování DNA příští generace?
Na rozdíl od metod mikroarray přístupy založené na sekvenci přímo určují sekvenci nukleové kyseliny dané molekuly DNA nebo cDNA.
prvním velkým vpádem do sekvenování DNA byl projekt lidského genomu. Tento projekt, který používal sekvenování první generace, známý jako Sanger sequencing (metoda ukončení řetězce), trval 13 let, stál 3 miliardy dolarů a byl dokončen v roce 2003.,
ve Srovnání s běžnými Sanger sekvenování pomocí kapilární elektroforézy, krátké čtení, které je masivně paralelní sekvenování technika je zásadně odlišný přístup, který revoluci sekvenování schopnosti a zahájila druhé generace sekvenování metody – nebo next-generation sequencing (NGS)–, které poskytují řádově více dat za mnohem nižší opakující se náklady.
sekvenování nové generace (NGS), známé také jako sekvenování s vysokou propustností, je termín catch-all používaný k popisu řady různých moderních sekvenačních technologií., Tyto technologie umožňují sekvenování DNA a RNA mnohem rychleji a levněji než dříve používané Sanger sekvenování, a jako takové revoluci studium genetiky a molekulární biologie. Tyto technologie zahrnují:
výhody NGS
NGS lze použít k analýze vzorků DNA a RNA a je oblíbeným nástrojem ve funkční genomice.,>vyšší dynamický rozsah signálu
NGS technologií
- Illumina (Solexa) sekvenování: Illumina sekvenování funguje současně identifikaci bází DNA, jako každá základna vysílá unikátní fluorescenční signál, a jejich přidání do řetězce nukleové kyseliny
- Roche 454 sekvenování: Tato metoda je založena na pyrosequencing, technika, která detekuje pyrofosforečnan vydání, opět za použití fluorescence, po nukleotidy jsou začleněny do polymeráza do nového vlákna DNA.,
- Ion Torrent: Proton / PGM sekvenování: Ion Torrent sekvenování opatření přímé uvolnění H+ (protony) od začlenění jednotlivých bází v DNA polymerázy a proto se liší od předchozích dvou metod, jak to neměří světlo.
následující stránky poskytují podrobné vysvětlení toho, jak každá z těchto technologií NGS funguje.,
Tyto Youtube videa poskytují užitečný přehled o tom, jak Sanger sekvenování a různé další generace technologie sekvencování práce a kdy je použít:
Next Generation Sequencing (NGS) – Úvod
Když mám použít Sanger Sekvenování vs. NGS? – Seq it out #7