Qu’est-ce que le séquençage de L’ADN de nouvelle génération?
contrairement aux méthodes de microréseau, les approches basées sur les séquences déterminent directement la séquence d’acides nucléiques d’une molécule d’ADN ou d’ADNc donnée.
la première grande incursion dans le séquençage de l’ADN a été le Projet Génome Humain. Ce projet, qui utilisait le séquençage de première génération, connu sous le nom de séquençage Sanger (la méthode de terminaison de chaîne), a duré 13 ans, a coûté 3 milliards de dollars et a été achevé en 2003.,
comparé au séquençage Sanger classique utilisant l’électrophorèse capillaire, la technique de séquençage massivement parallèle à lecture courte est une approche fondamentalement différente qui a révolutionné les capacités de séquençage et lancé les méthodes de séquençage de deuxième génération-ou séquençage de nouvelle génération (NGS) – qui fournissent des ordres de grandeur plus de données à un coût récurrent beaucoup plus faible.
le séquençage de nouvelle génération (NGS), également connu sous le nom de séquençage à haut débit, est le terme fourre-tout utilisé pour décrire un certain nombre de différentes technologies de séquençage modernes., Ces technologies permettent le séquençage de L’ADN et de L’ARN beaucoup plus rapidement et à moindre coût que le séquençage Sanger précédemment utilisé, et ont ainsi révolutionné l’étude de la génomique et de la biologie moléculaire. Ces technologies comprennent:
avantages de NGS
NGS peut être utilisé pour analyser des échantillons D’ADN et D’ARN et est un outil populaire en génomique fonctionnelle.,>une plage dynamique de signal plus élevée
NGS technologies
- séquençage Illumina (Solexa): le séquençage Illumina fonctionne en identifiant simultanément les bases D’ADN, chaque base émettant un signal fluorescent unique, et en les ajoutant à une chaîne d’acides nucléiques
- séquençage Roche 454: cette méthode est basée sur le pyroséquençage, une technique qui détecte la libération de pyrophosphate, toujours en utilisant la fluorescence, après que les nucléotides sont incorporés par polymérase à un nouveau brin d’ADN.,
- Ion Torrent: séquençage Proton / PGM: Ion Torrent sequencing mesure la libération directe de H+ (protons) à partir de l’incorporation de bases individuelles par L’ADN polymérase et diffère donc des deux méthodes précédentes car il ne mesure pas la lumière.
les pages suivantes fournissent des explications étape par étape sur le fonctionnement de chacune de ces technologies NGS.,
ces vidéos Youtube donnent un aperçu utile de la façon dont le séquençage Sanger et les différentes technologies de séquençage de nouvelle génération fonctionnent et quand les utiliser:
Next Generation Sequencing (NGS) – An Introduction
Quand dois-je utiliser le séquençage Sanger vs NGS? – Seq, Il Out #7