Vad är Nästa Generations DNA-Sekvensering?
i motsats till mikroarraymetoder bestämmer sekvensbaserade tillvägagångssätt direkt nukleinsyresekvensen för en given DNA-eller cDNA-molekyl.
den första stora rasten i DNA-sekvensering var det mänskliga genomprojektet. Detta projekt, som använde första generationens sekvensering, känd som Sanger-sekvensering (kedjetermineringsmetoden), tog 13 år, kostade 3 miljarder dollar och slutfördes 2003.,
jämfört med konventionell Sanger-sekvensering med hjälp av kapillärelektrofores är den korta läs -, massivt parallella sekvenseringstekniken ett fundamentalt annorlunda tillvägagångssätt som revolutionerade sekvenseringsförmågan och lanserade andra generationens sekvenseringsmetoder – eller nästa generations sekvensering (NGS)-som ger storleksordningar mer data till mycket lägre återkommande kostnad.
nästa generations sekvensering (ngs), även känd som hög genomströmning sekvensering, är catch-all term som används för att beskriva ett antal olika moderna sekvenseringsteknik., Dessa tekniker möjliggör sekvensering av DNA och RNA mycket snabbare och billigt än den tidigare använda Sanger-sekvenseringen, och som sådan revolutionerade studien av genomik och molekylärbiologi. Sådana tekniker inkluderar:
fördelar med NGS
NGS kan användas för att analysera DNA-och RNA-prover och är ett populärt verktyg inom funktionell genomik.,> högre dynamiskt signalområde
ngs technologies
- Illumina (Solexa) sekvensering: Illumina sekvensering fungerar genom att samtidigt identifiera DNA-baser, eftersom varje bas avger en unik fluorescerande signal, och lägga till dem i en nukleinsyrakedja
- Roche 454 sekvensering: detta är en metoden är baserad på Pyrosequencing, en teknik som detekterar pyrofosfatfrisättning, igen med fluorescens, efter nukleotider införlivas genom polymeras till en ny sträng av DNA.,
- ion Torrent: Proton / PGM sekvensering: Ion Torrent sekvensering mäter direkt frisättning av H +(protoner) från införlivandet av enskilda baser genom DNA-polymeras och skiljer sig därför från de tidigare två metoderna eftersom det inte mäter ljus.
de närmaste sidorna ger steg-för-steg-förklaringar om hur var och en av dessa NGS-tekniker fungerar.,
dessa Youtube-videor ger en användbar översikt över hur Sanger-sekvensering och nästa generations sekvenseringsteknik fungerar och när man ska använda dem:
nästa generations sekvensering (NGS) – en introduktion
När använder jag Sanger-sekvensering vs. NGS? – Seq Det Ut #7