mikä on seuraavan sukupolven DNA-sekvensointi?
toisin kuin microarray menetelmiä, sekvenssi-perustuvat lähestymistavat suoraan määrittää nukleiinihapposekvenssin tietyn DNA-tai ekspressio-molekyylin.
ensimmäinen merkittävä foray DNA-sekvensointiin oli Human Genome Project. Tämä ensimmäisen sukupolven sekvensointia käyttänyt, Sanger sequencing-nimellä tunnettu projekti kesti 13 vuotta, maksoi 3 miljardia dollaria ja valmistui vuonna 2003.,
Verrattuna perinteisiin Sanger sekvensointi käyttäen kapillaari elektroforeesi, lyhyen lukea, massiivisesti rinnakkaisen sekvensointi tekniikka on täysin erilainen lähestymistapa, joka mullisti sekvensointi valmiudet ja käynnisti toisen sukupolven sekvensointi menetelmät – tai seuraavan sukupolven sekvensointi (NGS) – jotka tarjoavat kertaluokkia enemmän tietoa paljon pienempi toistuvia kustannuksia.
Seuraavan sukupolven sekvensointi (NGS), joka tunnetaan myös nimellä high-throughput sequencing, on kiinni kaikki termi, jota käytetään kuvaamaan useita eri moderni sekvensointitekniikkaan., Nämä teknologiat mahdollistavat sekvensointi DNA: n ja RNA: n paljon nopeammin ja halvemmalla kuin aiemmin käytetty Sanger-sekvensointi, ja siten mullistanut tutkimuksen genomiikka ja molekyylibiologian. Tällaisia teknologioita ovat:
Edut NGS
NGS voidaan analysoida DNA-ja RNA-näytteet, ja on suosittu väline toiminnallinen genomiikka.,>suurempi dynaaminen alue signaali
NGS technologies
- Illumina (Solexa) sekvensointi: Illumina sekvensointi toimii samanaikaisesti tunnistaa DNA emäkset, kuten jokainen pohja säteilee ainutlaatuinen fluoresoiva signaali, ja lisäämällä ne nukleiinihapon ketjun
- Rochen 454-sekvensointi: Tämä menetelmä perustuu pyrosequencing, tekniikka, joka havaitsee pyrofosfaatin julkaisu, uudelleen käyttämällä fluoresenssi, kun nukleotidit ovat sisällytetty polymeraasi uuden DNA: ta.,
- Ion Torrent: Proton / PGM sekvensointi: Ion Torrent sekvensointi toimenpiteitä suora vapauttaa H+ (protonit) sisällyttämisestä yksittäiset emäkset DNA-polymeraasi ja näin ollen eroaa kahden edellisen menetelmiä, koska se ei mittaa valoa.
seuraavat sivut tarjoavat vaiheittaiset selitykset siitä, miten kukin näistä NGS-teknologioista toimii.,
Näitä Youtube-videoita, antaa hyödyllisen yleiskuvan siitä, miten Sanger sekvensointi ja eri seuraavan sukupolven sekvensointi tekniikat toimivat ja milloin käyttää niitä:
Seuraavan Sukupolven Sekvensointi (NGS) – Johdanto
Kun voin käyttää Sanger Sekvensointi vs. NGS? – Seq It Out #7