Hvad er næste generations DNA-sekventering?
i modsætning til mikroarray-metoder bestemmer sekvensbaserede fremgangsmåder direkte nukleinsyresekvensen for et givet DNA-eller cDNA-molekyle.
det første store forsøg på DNA-sekventering var Human Genome Project. Dette projekt, der brugte første generations sekventering, kendt som Sanger se .uencing (kæde-termineringsmetoden), tog 13 år, kostede 3 milliarder dollars og blev afsluttet i 2003.,
i Forhold til konventionelle Sanger sekventering ved hjælp af kapillarelektroforese, kort læse, massivt parallel bestemmelse teknik er en grundlæggende anderledes tilgang, der revolutionerede sekventering kapaciteter og lanceret den anden-generations sekventering metoder – eller næste-generation sequencing (NGS) – at give størrelsesordener mere data til langt lavere tilbagevendende omkostninger.
Næste-generation sequencing (NGS), også kendt som high-throughput-sekventering, er catch-all sigt bruges til at beskrive en række forskellige moderne sequencing teknologier., Disse teknologier giver mulighed for sekventering af DNA og RNA meget hurtigere og billigere end den tidligere anvendte Sanger-sekventering, og som sådan revolutionerede undersøgelse af genetik og molekylær biologi. Sådanne teknologier inkluderer:
fordele ved NGS
NGS kan bruges til at analysere DNA-og RNA-prøver og er et populært værktøj inden for funktionel genomik.,>højere dynamikområde signal,
NGS-teknologier
- Illumina (Solexa) sekventering: Illumina sekventering virker ved samtidigt at identificere DNA-baser, som hver base udsender en unik fluorescerende signal, og tilføje dem til en nukleinsyre kæde
- Roche 454 sekventering: Denne metode er baseret på pyrosekventering, en teknik, der registrerer pyrofosfat udgivelse, igen ved hjælp af fluorescens, efter nukleotider, der er omfattet af polymerase til en ny streng af DNA.,
- Ion Torrent: Proton / PGM-sekventering: Ion Torrent-sekventering foranstaltninger, der er den direkte udledning af H+ (protoner) fra indarbejdelse af enkelte baser med DNA-polymerase og derfor adskiller sig fra de to foregående metoder, da det ikke måler lyset.
de næste par sider giver trinvise forklaringer på, hvordan hver af disse NGS-teknologier fungerer.,
Disse Youtube-videoer, der giver et nyttigt overblik over, hvordan Sanger-sekventering og de forskellige next generation sequencing teknologier-arbejde og hvornår du skal bruge dem:
Next Generation Sequencing (NGS) – En Introduktion
Hvornår skal jeg bruge Sanger Sekventering vs. NGS? – Se Seq It out # 7