mi a következő generációs DNS szekvenálás?
a mikroarray módszerekkel ellentétben a szekvencia-alapú megközelítések közvetlenül meghatározzák egy adott DNS vagy cDNA molekula nukleinsav-szekvenciáját.
a DNS-szekvenálás első fő fordulata a humán genom projekt volt. Ez a projekt, amely első generációs szekvenálást használt, Sanger szekvenálás néven ismert (a láncvégződési módszer), 13 évig tartott, 3 milliárd dollárba került, és 2003-ban fejeződött be.,
ahhoz Képest, hogy a hagyományos Sanger szekvenálás segítségével kapilláris elektroforézis, a rövid olvasni, masszívan párhuzamos sorozatot, hogy a technika egy alapvetően eltérő megközelítés, amely forradalmasította sorozatot, képességek, valamint elindította a második generációs szekvenálási módszerek – vagy újgenerációs szekvenálás (NGS)–, amelyek nagyságrenddel több adatot sokkal alacsonyabb visszatérő költség.
A következő generációs szekvenálás (NGS), más néven nagy áteresztőképességű szekvenálás, a catch-all kifejezés, amelyet számos különböző modern szekvenálási technológia leírására használnak., Ezek a technológiák sokkal gyorsabban és olcsóbban képesek szekvenálni a DNS-t és az RNS-t, mint a korábban használt Sanger szekvenálás, így forradalmasították a genomika és a molekuláris biológia tanulmányozását. Ilyen technológiák a következők:
az NGS előnyei
az NGS felhasználható DNS-és RNS-minták elemzésére, és népszerű eszköz a funkcionális genomikában.,>nagyobb dinamikatartomány jel
NGS technológiák
- Illumina (Solexa) szekvencia: Illumina szekvenálás működik, hogy egyszerre azonosítása DNS bázisokat, mint minden alap bocsát ki, egyedi fluoreszcens jel, valamint egészítsük ki őket, hogy egy nukleinsav-lánc
- Roche 454 szekvenálás: Ez a módszer azon alapul, hogy pyrosequencing, egy technika amely érzékeli pyrophosphate kiadás, újra a fluoreszcencia segítségével, miután nukleotid beépítik által polimeráz, hogy egy új DNS.,
- Ion Torrent: Proton / PGM szekvenálás: az Ion Torrent szekvenálás a H+ (protonok) közvetlen felszabadulását méri az egyes bázisok DNS-polimeráz általi beépüléséből, ezért különbözik az előző két módszertől, mivel nem méri a fényt.
a következő néhány oldal lépésről lépésre elmagyarázza, hogyan működnek ezek az NGS technológiák.,
Ezek a Youtube videók egy hasznos áttekintést, hogy Sanger szekvenálás, valamint a különböző következő generációs szekvenálási technológiák a munkát, hogy használja őket:
az újgenerációs Szekvenálás (NGS) – Bevezetés
Mikor használjam Sanger Szekvenálás vs NGS? – Seq It Out # 7