Hva er Neste Generasjon DNA-Sekvensering?
I motsetning til microarray metoder, sekvens-baserte tilnærminger direkte bestemme nucleic acid sequence av en gitt DNA-eller cDNA-molekylet.
Den første store steg inn i DNA-sekvensering ble det Humane Genom-Prosjektet. Dette prosjektet, som brukes første generasjons sekvensering, kjent som Sanger-sekvensering (kjeden-avslutning-metode), tok 13 år, koster $3 milliarder kroner og var ferdig i 2003.,
i Forhold til konvensjonelle Sanger-sekvensering ved hjelp av kapillær elektroforese, den korte lese, massivt parallelle sekvenser teknikk er et fundamentalt annerledes tilnærming som revolusjonerte sekvensering evner og lansert den andre-generasjons sekvensering metoder – eller neste-generasjons sekvensering (NGS) – som gir størrelsesordener mer data på et mye lavere løpende kostnader.
Neste generasjons sekvensering (NGS), også kjent som høy gjennomstrømning sekvensering, er den altomfattende begrep som brukes for å beskrive en rekke forskjellige moderne sekvensering teknologier., Disse teknologiene tillate for sekvensering av DNA og RNA mye raskere og billigere enn den tidligere brukte Sanger-sekvensering, og som sådan revolusjonert studiet av genomics and molecular biology. Slike teknologier er:
Fordeler av NGS
NGS kan brukes til å analysere DNA-og RNA-prøvene og er et populært verktøy i functional genomics.,>høyere dynamisk utvalg av signal
NGS teknologier
- Illumina (Solexa) sekvensering: Illumina-sekvensering fungerer ved samtidig å identifisere DNA-baser, som hver base avgir en unik fluorescerende signal, og legger dem til en nukleinsyre chain
- Roche 454-sekvensering: Denne metoden er basert på pyrosequencing, en teknikk som oppdager pyrophosphate utgivelsen, igjen ved hjelp av fluorescens, etter nukleotider er innarbeidet med polymerase til en ny strand av DNA.,
- Ion Torrent: Proton / PGM-sekvensering: Ion Torrent-sekvensering tiltak direkte utslipp av H+ (protoner) fra inkorporering av enkelte baser ved DNA-polymerase og derfor skiller seg fra de foregående to metoder som det ikke måle lys.
De neste sidene gir steg-for-trinn-forklaringer på hvordan hver av disse NGS teknologien fungerer.,
Disse Youtube-videoer gir en nyttig oversikt over hvordan Sanger-sekvensering og de ulike neste generasjons sekvensering teknologien fungerer og når du skal bruke dem:
Neste Generasjons Sekvensering (NGS) – En Introduksjon
Når skal jeg bruke Sanger-Sekvensering vs. NGS? – Seq Det Ut #7