ce este secvențierea ADN de generație următoare?
spre deosebire de metodele microarray, abordările bazate pe secvențe determină direct secvența de acid nucleic a unei molecule ADN sau cDNA date.
prima incursiune majoră în secvențierea ADN a fost Proiectul genomului uman. Acest proiect, care a folosit secvențierea de primă generație, cunoscut sub numele de secvențiere Sanger (metoda de terminare a lanțului), a durat 13 ani, a costat 3 miliarde de dolari și a fost finalizat în 2003.,
în Comparație cu convenționale de secvențiere Sanger folosind electroforeza capilara, scurt citit, masiv paralel secvențiere tehnica este o abordare fundamental diferită care a revoluționat secvențiere capacitățile și-a lansat cea de-a doua generație de secvențiere metode – sau next-generation sequencing (NGS) – care oferă ordine de magnitudine mai multe date la mult mai mici costuri recurente.secvențierea de generație următoare (NGS), cunoscută și sub denumirea de secvențiere de mare viteză, este termenul catch-all folosit pentru a descrie o serie de tehnologii moderne de secvențiere diferite., Aceste tehnologii permit secvențierea ADN și ARN mult mai rapid și mai ieftin decât secvențierea Sanger utilizată anterior și, ca atare, a revoluționat studiul genomicii și biologiei moleculare. Astfel de tehnologii includ:
avantajele NGS
NGS poate fi folosit pentru a analiza ADN și ARN probe și este un instrument popular în genomica funcțională.,>mai mare gama dinamică a semnalului
NGS tehnologii
- Illuminati („Solea”) secvențiere: Illuminati secvențiere lucrări de simultan identificarea ADN baze, ca fiecare bază emite un unic semnalului fluorescent, și a le adăuga la un acid nucleic lanț
- Roche 454 secvențiere: Această metodă se bazează pe pyrosequencing, o tehnică ce detectează pirofosfat de presă, din nou, folosind fluorescența, după nucleotide sunt încorporate prin reacția de polimerizare la un nou fir de ADN.,
- ion Torrent: secvențierea protonului / PGM: secvențierea torentului Ion măsoară eliberarea directă a h+ (protoni) din încorporarea bazelor individuale prin ADN polimerază și, prin urmare, diferă de cele două metode anterioare, deoarece nu măsoară lumina.următoarele câteva pagini oferă explicații pas cu pas despre modul în care funcționează fiecare dintre aceste tehnologii NGS.,aceste videoclipuri Youtube oferă o imagine de ansamblu utilă a modului în care funcționează secvențierea Sanger și a diferitelor tehnologii de secvențiere de generație următoare și când să le folosesc:
secvențierea de generație următoare (NGS) – o introducere
când folosesc secvențierea Sanger vs. NGS? – Seq – l # 7