次世代DNAシークエンシングとは何ですか?
マイクロアレイ法とは対照的に、配列ベースのアプローチは、所与のDNAまたはcDNA分子の核酸配列を直接決定する。
DNAシークエンシングへの最初の主要な進出は、ヒトゲノムプロジェクトでした。 このプロジェクトは、Sanger sequencing(chain-termination method)として知られている第一世代のシーケンシングを使用し、13年かかり、3億ドルの費用がかかり、2003年に完了しました。,
キャピラリー電気泳動を用いた従来のサンガーシーケンシングと比較して、短い読み取り、超並列シーケンシング技術は、シーケンシング機能に革命をもたらし、はるかに低い定期的なコストで桁違いのデータを提供する第二世代シーケンシング方法または次世代シーケンシング(NGS)を立ち上げた根本的に異なるアプローチです。
次世代シーケンシング(ngs)は、ハイスループットシーケンシングとも呼ばれ、多くの異なる現代のシーケンシング技術を記述するために使用されるキャッチオール, これらの技術は、以前に使用されていたサンガーシーケンシングよりもはるかに迅速かつ安価にDNAとRNAのシーケンシングを可能にし、そのようにゲノミクスと分子生物学の研究に革命をもたらした。 このような技術には、
NGSの利点
NGSは、DNAおよびRNAサンプルを分析するために使用することができ、機能的ゲノミクスにおいて一般的なツールである。,高い再現性
NGS technologies
- Illumina(Solexa)シーケンシング:Illuminaシーケンシングは、各塩基が一意の蛍光シグナルを放出すると同時にDNA塩基を同定し、核酸鎖に追加することによって機能します
- Roche454シーケンシング:この方法は、入力として必要とされるDNA/RNAを少なくすることによって機能します。ピロシークエンシングは、ヌクレオチドがポリメラーゼによってdnaの新しい鎖に組み込まれた後、蛍光を使用して、再びピロリン酸放出を検出する技術です。,
- Ion Torrent:Proton/PGM sequencing:Ion Torrent sequencingは、DNAポリメラーゼによる個々の塩基の取り込みからH+(プロトン)の直接放出を測定するため、光を測定しないため、前の二つの方法とは異なります。
次のいくつかのページでは、これらのNGS技術のそれぞれがどのように機能するかについて段階的に説明しています。,
これらのYoutubeビデオは、サンガーシーケンシングと異なる次世代シーケンシング技術がどのように機能するか、そしていつそれらを使用するかについての有用な概要を示しています。
次世代シーケンシング(NGS)–はじめに
いつ私はサンガーシーケンシング対NGSを使用するのですか? -Seq It Out#7