Ligase
de veel voorkomende namen van ligasen omvatten vaak het woord “ligase”, zoals DNA-ligase, een enzym dat vaak wordt gebruikt in laboratoria voor moleculaire biologie om DNA-fragmenten samen te voegen. Andere gemeenschappelijke namen voor ligases omvatten het woord “synthetase”, omdat zij worden gebruikt om nieuwe molecules te synthetiseren.
biochemische nomenclatuur heeft soms synthetases onderscheiden van synthases en soms behandeld de woorden als Synoniemen., Volgens één definitie gebruiken synthasen geen energie uit nucleosidetrifosfaten (zoals ATP, GTP, CTP, TTP en UTP), terwijl synthetasen wel nucleosidetrifosfaten gebruiken. Er wordt ook gezegd dat een synthase een lyase is (een lyase is een enzym dat het breken van verschillende chemische bindingen katalyseert door andere middelen dan hydrolyse en oxidatie, vaak het vormen van een nieuwe dubbele binding of een nieuwe ringstructuur) en geen energie nodig heeft, terwijl een synthetase een ligase is (een ligase is een enzym dat twee chemicaliën of verbindingen bindt) en dus energie nodig heeft., De Joint Commission on Biochemical Nomenclature (JCBN) schrijft echter voor dat “synthase” kan worden gebruikt met elk enzym dat de synthese katalyseert (ongeacht of het nucleoside trifosfaten gebruikt), terwijl “synthetase” synoniem moet worden gebruikt.