Wat is de volgende generatie DNA-Sequencing?
in tegenstelling tot microarray-methoden bepalen sequentiegebaseerde benaderingen direct de nucleïnezuursequentie van een bepaald DNA-of cDNA-molecuul.
het eerste belangrijke onderzoek naar DNA-sequencing was het Human Genome Project. Dit project, dat eerst-generatie het rangschikken gebruikte, als sanger het rangschikken (de ketting-beëindigingsmethode) wordt bekend, nam 13 jaar, kostte $3 miljard en in 2003 werd voltooid.,
vergeleken met conventionele Sanger sequencing met behulp van capillaire elektroforese, is de short read, massively parallel sequencing technique een fundamenteel andere benadering die een revolutie teweegbracht in de sequencing mogelijkheden en de tweede generatie sequencing methoden lanceerde-of next – generation sequencing (NGS)-die ordes van grootte meer gegevens leveren tegen veel lagere terugkerende kosten.
next-generation sequencing (NGS), ook bekend als high-throughput sequencing, is de algemene term die wordt gebruikt om een aantal verschillende moderne sequencingtechnologieën te beschrijven., Deze technologieën staan voor het rangschikken van DNA en RNA veel sneller en goedkoper toe dan het eerder gebruikte rangschikken van Sanger, en als zodanig revolutioneerden de studie van genomics en moleculaire biologie. Dergelijke technologieën omvatten:
voordelen van NGS
NGS kan worden gebruikt om DNA-en RNA-monsters te analyseren en is een populair instrument in functionele genomica.,>hoger dynamisch bereik van signaal
NGS technologieën
- Illumina (Solexa) sequencing: Illumina sequencing werkt door gelijktijdig de identificatie van DNA-basen, zoals elk basisstation zendt een unieke tl-signaal, en ze toe te voegen aan een nucleïnezuur chain
- Roche 454 sequencing: Deze methode is gebaseerd op pyrosequencing, een techniek die detecteert pyrofosfaat release, opnieuw met behulp van fluorescentie, na nucleotiden worden opgenomen door de polymerase naar een nieuwe DNA-streng.,
- Ion Torrent: Proton / PGM sequencing: Ion Torrent sequencing meet de directe afgifte van H+ (protonen) uit de inbouw van individuele basen door DNA-polymerase en verschilt daarom van de vorige twee methoden omdat het geen licht meet.
de volgende pagina ‘ s geven stap-voor-stap uitleg over hoe elk van deze NGS-technologieën werkt.,
Deze Youtube-video ‘ s geven een nuttig overzicht van hoe Sanger sequencing en de verschillende next generation sequencing technologieën werken en wanneer ze te gebruiken:
Next Generation Sequencing (NGS) – een inleiding
Wanneer gebruik ik Sanger Sequencing vs. NGS? – Seq It Out # 7